Меню
Набор скоро начнётся NCT06542042

Application of Nanopore Adaptive Sequencing

— Наблюдательное Liver Transplant Infection

Ориентир для пациента и семьи

Простыми словами

Автоматическая сводка по структурированным данным реестра. Она помогает сориентироваться, но не заменяет официальный протокол или оценку врача.

Что изучают
В протоколе указаны: NAS, NGS and Laboratory tests.
Кому может быть актуально
Состояния в реестре: Liver Transplant Infection. Базовые параметры: Без ограничений · Все.
Что важно проверить
Возраст, диагноз и пол — только базовые ориентиры. Предыдущее лечение, анализы и другие обязательные условия указаны ниже в критериях участия.
Где проводится
Китай
Следующий шаг
Сохраните исследование, покажите его лечащему врачу и уточните актуальный статус у исследовательского центра. Расходы, документы и поездка →

Не всё понятно в терминах? Прочитайте наш гид для пациентов →

Официальное название

Application of Oxford Nanopore Adaptive Sequencing Method in Infection Post Liver Transplantation

Обзор

Infection post liver transplantation is an important factor in the death in patients. The traditional method of diagnosing infection post liver transplantation is laboratory tests. But the sensitivity and specificity of blood tests is poor. Next-generation sequencing (NGS) has greater detection rate for mycobacterium tuberculosis, anaerobes and fungi and greater sensitivity compare with blood tests. However use of NGS is limited because of the short read-length. Oxford nanopore adaptive sequencing (NAS) method is the Third Revolution in Sequencing Technology. For each 1 Gbp of data, NAS sequencing detected 45 times more microbiome sequences than Nanopore standard sequencing and 2.5 times more than Illumina sequencing. The purpose of this study is to compare NAS with NGS and laboratory tests for the diagnostic rate of infection post liver transplantation.

Подробное описание

Based on the previous work, the investigators found that: 1. NAS has a higher microbial enrichment efficiency and can detect pathogenic information more quickly compared with nanopores normal sequencing (NNS); 2. NAS can detect more specific pathogen fragments with short-time sequencing; 3. NAS can cover more pathogenic genomes than NNS in a short-time; 4. NAS can detect antibiotic resistance information of pathogenic bacteria in clinical samples.

Вмешательства

  • Диагностический тест NAS, NGS and Laboratory tests
    Using three diffrent detection methods and comparing their efficiency

Первичные конечные точки

  • Diagnosed infection post liver transplantation [Срок оценки: Post liver transplantation before patients discharge from hospital, an average of 1 months.]

Критерии участия

Критерии включения

  • Accept liver transplantation
  • Signing informed consent voluntarily
  • Possessing ability to comprehend material information
  • Participating this study voluntarily

Критерии исключения

  • Participated another study
  • Graft loss
  • Have undergone a multi-organ transplantion or have had a previous organ transplantation
  • Patient died

Критерии приведены из реестра в оригинале (на английском). Окончательную оценку соответствия проводит исследовательский центр.

Здоровые добровольцы: Нет

Дизайн исследования

Модель наблюдения
Только случаи

Центры проведения

Китай · 1 центр
  • Shenzhen Third People's Hospital — Шэньчжэнь

Публикации

  • Cheng H, Sun Y, Yang Q, Deng M, Yu Z, Zhu G, Qu J, Liu L, Yang L, Xia Y. A rapid bacterial pathogen and antimicrobial resistance diagnosis workflow using Oxford nanopore adaptive sequencing method. Brief Bioinform. 2022 Nov 19;23(6):bbac453. doi: 10.1093/bib/bbac453. PMID 36259361

Идентификаторы

NCT: NCT06542042 · SZSY001 · 2022YFC2304700

Первоисточники (государственные реестры)

Открыть это исследование на ClinicalTrials.gov ↗